Обнаружил что в скриптах сборки время от времени подвисает node-pre-gyp, который скачивает прекомпилированные бинарные библиотеки.
Начал выяснять откуда он их пытается скачать - оказывается, github.
Проверил github без VPN - оказывается, релизы с release-assets.githubusercontent.com не скачиваются. Причем из консоли еще скачиваются, из браузера не открываются. Вероятно, иногда и из консоли блокируется.
То есть частичная блокировка гитхаба все еще продолжается. Замечу, что он используется в огромном числе скриптов сборки огромного числа продуктов, и заменить его на зеркала централизовано нельзя, да и далеко не всегда известно, какой именно файл какая именно программа будет скачиваться.